Skip to content

Dwa fenotypy kliniczne w wazice czerwienicy AD 3

1 miesiąc ago

432 words

Analiza mikromacierzy oligonukleotydów została przeprowadzona przy użyciu układu Affymetrix U133A (szczegółowe informacje zawiera Dodatek Uzupełniający). Dane z mikromacierzy zostały zdeponowane w bazie danych Gene Expression Omnibus MIAME (minimum informacji o doświadczeniu na mikromacierzy) (www.ncbi.nlm.nih.gov/geo) pod numerem dostępu GSE47018. Wyniki
Pacjenci
Tabela 1. Tabela 1. Cechy kliniczne populacji badanej według płci. Kliniczne cechy 19 pacjentów wymieniono w tabeli oraz w tabeli S1 w dodatkowym dodatku. Mediana wieku i czasu trwania choroby nie różniły się istotnie pomiędzy kobietami i mężczyznami. Wszyscy pacjenci mieli ekspresję JAK2 V617F, a średnie obciążenie allelami neutrofili było również podobne u mężczyzn i kobiet (odpowiednio 94% i 100%); u 13 pacjentów średnie obciążenie allelami komórek CD34 + JAK2 V617F wynosiło 82% (zakres od 50 do 100) (danych nie pokazano), co wskazuje na dominację klonalną zarówno na poziomie komórek progenitorowych, jak i neutrofili.13 Obie grupy różniły się istotnie tylko w odniesieniu do liczby płytek krwi, u mężczyzn mających niższą medianę liczby płytek krwi niż u kobiet (421,000 vs. 948,000 na milimetr sześcienny; P = 0,02).
Ekspresja genu u pacjentek płci męskiej i żeńskiej
Biorąc pod uwagę różnice w zachowaniu chorobowym mężczyzn i kobiet z czerwienicą prawdziwą, postawiliśmy hipotezę, że mogą występować różnice w ekspresji genów zależne od płci, które są niezależne od ekspresji JAK2 V617F. Dlatego porównaliśmy ekspresję genów u pacjentów z grupą kontrolną odpowiadającej płci i odkryliśmy, że występuje zróżnicowana ekspresja genów u pacjentek w porównaniu z pacjentami płci męskiej, z 235 genami różnie regulowanymi (126 w górę i 109 w dół) u kobiet, w porównaniu z 571 genami różnie regulowanymi (486 z podwyższoną regulacją i 85 z obniżoną regulacją) u mężczyzn (tabele S2A i S2B w dodatkowym dodatku). Pomimo faktu, że pacjentki miały mniejszą liczbę zderegulowanych genów, analiza Enoclopedia of Genes and Genomes (KEGG) z Kioto wykazała, że u pacjentek aktywowano więcej niż trzykrotnie więcej ścieżek molekularnych, w tym jeden – szlak pentozofosforanowy – która nie została aktywowana u żadnego pacjenta płci męskiej (ryc. S1A i S1B w dodatkowym dodatku).
Identyfikacja zharmonizowanych genów u kobiet i mężczyzn
Odejmowanie genów za pomocą ekspresji specyficznej dla płci pozostawiło 102 geny (68 regulowane w górę i 34 regulowane w dół) z różnicową ekspresją, która była zgodna u mężczyzn i kobiet (ryc. S2 w dodatku uzupełniającym) i który był potencjalnym zestawem rdzeni geny zaangażowane w patogenezę czerwienicy prawdziwej
[patrz też: kwas hialuronowy, olej arganowy, olejek makadamia ]

Powiązane tematy z artykułem: kwas hialuronowy olej arganowy olejek makadamia