Skip to content

Dwa fenotypy kliniczne w wazice czerwienicy AD 4

1 miesiąc ago

397 words

Zatwierdziliśmy ekspresję genu dla 9 ze 102 genów za pomocą ilościowego testu PCR z odwrotną transkryptazą (RT-PCR) (Tabela S3 w Dodatkowym dodatku), stosując komórki CD34 + z podgrupy pacjentów i stwierdzono, że było ścisła korelacja między obserwowanymi zmianami ekspresji genu mikromacierzy a ilościowymi pomiarami RT-PCR. (Rys. S3 w Uzupełniającym dodatku) Adnotacja na temat zdysocjowanych genów
Adnotację o 102 genach podano w tabeli S4 w dodatkowym dodatku. Występowała zróżnicowana regulacja genów podtrzymujących komórki macierzyste HES1, HOXA9, PTGER4 i NR4A2; główny czynnik transkrypcyjny SOX4; oraz onkogenów SETBP1 i MIR21. Osiem genów antyapoptotycznych (LEPR, CKAP4, RRAS2, TIMP1, IER3, THBS1, POSTN i LGALS3) było regulowanych w górę, oraz sześć genów proapoptotycznych (EIF5A, EMP1, ZFP36L2, LUC7L3, HLF i HOPX) i trzy geny supresorowe guza (SSBP2, TLE4 i KLF6) zostały obniżone.
W sumie 16 genów macierzy pozakomórkowej, w tym 6 genów kolagenu (COL1A1, COL1A2, COL3A1, COL4A1, COL4A2 i COL6A3) oraz geny macierzyste SPARC, POSTN, TIMP1, THBS1, HPSE, FN1, S100A9, EFEMP1, LGALS3 oraz LTBP3 były regulowane w górę, zasadniczo stanowiąc sygnaturę genu zrębu . To stwierdzenie jest zgodne ze skłonnością do rozwoju mielofibrozy u pacjentów z czerwienicą prawdziwą. Ponadto stwierdzono zwiększoną ekspresję 10 cytokin i genów mediatorów stanu zapalnego – CCL3 (MIP1A), CCL5 (RANTES), CXCL5, SERPINE1 (PAI1), S100A9, LCN2, PTX3, PF4V1, FCN1 i CFD – które podobnie stanowiły cytokinę . sygnatura genu odkrycie zgodne ze środowiskiem zapalnym, które charakteryzuje zaburzenia mieloproliferacyjne
Hierarchiczne klastrowanie bez nadzoru z zdysiedlowanymi genami
Rycina 1. Dendrogram i mapa ciepła dla nienadzorowanego hierarchicznego klastrowania u 19 pacjentów z czerwienicą prawdziwą i 6 kontrolnymi, na podstawie 102 genów rdzeniowych zgodnych z deregulacją u obu płci. W mapie cieplnej każda kolumna reprezentuje indywidualnego pacjenta lub kontrolę, a każdy rząd reprezentuje pojedynczy gen. Czerwony oznacza obniżoną ekspresję genu i zieloną zwiększoną ekspresję genu. Na kolorowym pasku nad mapą ciepła zielony wskazuje grupę kontrolną, a niebieskie i czerwone paski kolorów wskazują 19 pacjentów z czerwienicą prawdziwą segregowanych zgodnie z ekspresją 102 rdzeniowych genów. Wirgony oddzielające dwa symbole genów (np. HBG1 /// HBG2) wskazują, że sonda Affymetrix nie rozróżniała genów; myślnik wskazuje, że RNA zidentyfikowany przez sondę nie został jeszcze zanotowany.
Tabela 2. Tabela 2. Cechy kliniczne rozdzielone przy użyciu nienadzorowanego hierarchicznego klastrowania
[więcej w: usuwanie blizn potrądzikowych, wzorcowanie termometrow, wzorcowanie przyrządów pomiarowych ]

Powiązane tematy z artykułem: usuwanie blizn potrądzikowych wzorcowanie przyrządów pomiarowych wzorcowanie termometrow